Nature:粘连蛋白释放遗传物质Wapl促进V基因重排的机制

2021-11-29 07:10:51 来源:
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巨噬细胞核内的一些生态学步骤,比如V(D)J自由基,有时候是由突变投影构象所依赖性,还包括突变区室(compartments)、拓扑相关结构域(topologically associated domains, 全名TADs)和核糖内侧(chromatin loop)等。TADs是由核糖内侧浸入(chromatin-loop extrusion)所呈现出的,而这一步骤缺少圆内侧圆形的隔膜肽一氧化氮(cohesion complex)。与之相对应的是,隔膜肽特赦表征Wapl可以上限核糖内侧的延伸(loop extension),从而发挥不胜向依赖性的关键作用。

一系列抗体的造成了,密切相关了体液免疫抵御外来病原体的主要含有,而抗体的社时会性,是由V(D)J自由基所构建的,这一步骤,缺少Pax5所酪氨酸的2.8Mb高约免疫球肽重链(immunoglobulin hey chain,全名lgh)等位基因座的伸长。然而在当年体B巨噬细胞(pre-B cells)中所,Pax5是如何依赖性lgh伸长的,仍旧未知。

近日,来自奥地利Vienna Biocenter的Meinrad Busslinger数据分析组在Nature上发表篇文章Wapl repression by Pax5 promotes V gene recombination by Igh loop extrusion的发表文章,阐明Pax5通过诱导Wapl,从而构建对lgh的依赖性。

因为核糖内侧浸入缺少黏土连肽一氧化氮,所以,写作者首先数据分析在当年体B巨噬细胞中所,隔膜肽一氧化氮各糖类的表述是否频发转变。写作者见到,在RNA总体上,比起于其他种类的免疫巨噬细胞,当年体B巨噬细胞和原B巨噬细胞(pro-B cell)的的Wapl总体降到了四倍。肽质总体也有类似的见到。这些结果或许,黏土连肽特赦表征Wapl的降到,很可能减小黏土连肽在核糖上的存留星期。

有报道认为,Pax5可以依赖性lgh等位基因座伸长,写作者月里阐述,Pax5是否可以阻碍Wapl在当年体B巨噬细胞中所的表述。写作者通过Pax5等位基因缺陷肠道见到,缺失了Pax5的当年体B巨噬细胞,Wapl的mRNA总体减小了4~6倍。另外,当年体B巨噬细胞中所,Wapl上缺少2个Pax5建构等位基因座P1和P2,而在成熟的B巨噬细胞中所,建构等位基因座提高至1个(存留P2)。这些结果说明了,在当年体B巨噬细胞中所,Pax5可以诱导Wapl总体。

在P1敲除肠道中所,骨髓中所的B巨噬细胞成年期大体停留在当年体B巨噬细胞过渡阶段,这说明了,B巨噬细胞成年期是颇受Wapl上Pax5建构等位基因座P1所依赖性的。另外,通过VDJ化学合成,写作者见到,P1敲除的肠道,当年体B巨噬细胞中所VDJH的自由基分之一纯着提高。而在Pax5敲除肠道中所,也举例来说见到类似的现象,并且,Pax5肠道lgh等位基因座无法进行伸长。这些结果说明了,Wapl上的Pax5建构等位基因座P1可以诱导lgh核糖内侧浸入。

再一,写作者注意Pax5对Wapl的诱导,是否时会阻碍当年体B巨噬细胞整个突变的结构。写作者见到,只有在B巨噬细胞成年期的早期过渡阶段,Pax5可以阻碍黏土连肽在核糖上的驻留星期。并且,与出现异常的当年体B巨噬细胞相比,Pax5敲除肠道的当年体巨噬细胞和P1,P2敲除的当年B巨噬细胞,其TADs中所核糖内侧的呈现出总体纯着提高;与此相对的是,大片段的核糖伸长,从而呈现出突变间隔的总体,却大为上升时。这些结果说明了,在原B巨噬细胞中所,Pax5的建构等位基因座P1所诱导的Wapl总体提高,微小阻碍了整个巨噬细胞的突变结构。

综上所述,写作者见到,在当年体B巨噬细胞和原B巨噬细胞中所,Pax5可以诱导黏土连肽特赦表征Wapl的表述,从而延高约黏土连肽在核糖上的驻留星期,进而促进核糖内侧浸入总体的上升时。这一步骤是通过Wapl上的Pax5建构等位基因座P1构建的。而且,Wapl表述总体的提高,可以惹来突变结构的整体转变,这也是当年体B巨噬细胞中所频发高总体的V等位基因自由基的可能原因之一。

值得一提的是,就在这篇Nature上线后的次日,先于印本bioRxiv上在线公布了来自哈佛大学Frederich Alt实验室篇文章“Loop Extrusion Mediates Physiological Locus Contraction for V(D)J Recombination”的类似管理工作,举例来说显然Wapl通过阻碍核糖内侧浸入阻碍等位基因自由基的举足轻重关键作用。

独有出处:

Louisa Hill 1, Anja Ebert 1, Markus Jaritz 1, et al.Wapl repression by Pax5 promotes V gene recombination by Igh loop extrusion.Nature. 2020 Jul 1. doi: 10.1038/s41586-020-2454-y.

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